Seit 3 Wochen dabei und einige Fragen an euch

1. Ich kann meine Offiziere ja befördern und neue Fähigkeiten beibringen, welche dabei ersetz wird kann ich aber nicht bestimmen oder?

Wenn du sie selber trainierst oder durch einen anderen Offizier schulen lässt, lässt sich das afaik nicht bestimmen. Wenn du durch den Brückenoffizierstrainer Leute schulst, theoretisch auch nicht, praktisch gibt es dort aber die meisten Fähigkeiten in zwei Varianten, dadurch kannst du zum Beispiel die schwächere Ensign-Fähigkeit nehmen, anstatt die Lieutenant-Variante, die eine von den Fähigkeiten, die du behalten möchtest, überschreiben würde.

2. Mit meinem Kreuzer nutze ich zur Zeit nur Phaserbänke und Torpedos, macht das sinn?

Joa, macht schon Sinn. Kreuzer sind nicht allzu beweglich, sollten daher über Waffen mit recht großen Schussbögen verfügen, aber allein mit Strahlern kommt man auch nicht soweit (ist außerdem nicht gut für die Waffenenergie).
Da Kreuzer oft auch ne ganze Weile den Gegner frontal attackieren können, ist meine Lieblingskonfiguration eigentlich 4 frontale schwere Doppelkanonen und hinten Geschütztürme oder beam-Arrays. Das haut mächtig rein, geht aber leider nur bei den Klingonen (vllt. auch bei den Romulanern, da ich die aber noch nicht gespielt habe, weiß ichs nicht). Bei den Föds hab ich durch die Anbringung eines frontalen Quantentorpedowerfers, einer Dualstrahlenbank, einer einfachen Kanone und eines Beam-Arrays einen Kompromiss zwischen Waffenbögen und Feuerkraft (Hinten hab ich noch einen Turret, ein Beam Array, einen Photonentorpedowerfer und einen Quantenminenwerfer). Im PvE leistet das eigentlich ganz solide Dienste und im PvP ist mir die Waffenkonfiguration eh relativ wumpe, da Kreuzer dort als Tanks fungieren, was meiner auch ganz gut hinkriegt.

3. Kenne bisher eine gute Quelle um schnell an Dilithium ran zu kommen, die "erkunde 3 System im Nebel" welche gibt es noch?

Das Asteroidenbergbau-Spektakel (irgendwo bei DS9 in der Nähe, wenn ich mich recht entsinne). Ist auch eigentlich ganz lustig, da mit Minigame und Raumanzug.
Ne gut ausgewählte und vorallendingen zahlreiche Duty-Officer-Besatzung kann auch etwas Dilithium ranholen.

4. Kann es sein das meine Missionen sich meinem Rang anpassen. Ich bin überrascht das ich trotz hohem lvl in niedrigen Missionen nicht "super entspannt" durchkomme. Ja läuft aber ich hatte erwartet es wäre leichter, mit dickem Schiff und guter Ausstatung am Boden

Jop, das ist so. Wenn man solo ne Mission macht, wird der Level der Gegner eigentlich immer auf den eigenen angepasst. Da Orioner und Gorn nicht soviele Tricks haben wie Borg und Romulaner ist das zwar trotzdem noch einfacher, aber grundsätzlich soll so jede Mission immer ne Herausforderung bieten (was ich persönlich ein bisschen bräsig finde: Wenn ich ein superduper-Schlachtschiff habe und dann jeder Kampf gegen nen Brigand-Kreuzer doch immer noch wieder ne Herausforderung ist, stellt sich ein wenig die Frage, wozu man sich ein solches Schiff holt, wenn man dann doch immer nur wieder auf dem gleichen Level wie die Piraten agiert.)

5. Durchs skillsystem arbeite ich mich mal weiter durch

Gut so. Ich finds persönlich einfacher seit dem Start. Die meisten Sachen wirken sich jetzt direkt auf Energielevel, Schikdstärke, Hülle, Wafenstärke usw. aus, früher war das ja alles ein Wust an Talenten, die alle irgendwelche Fähigkeiten gesteigert haben und wenn man da dann ein paar Fähigkeiten austauschte, war die Berechnung fürn Arsch. Lediglich Wissenschaft ist noch ne Wissenschaft für sich, aber auch schon besser geworden.

Sinnhaftigkeit

Was ich als Sinn bei einem Computerspielchen definiere, bestimme ich immer noch selbst

Übrigens macht sich "Wundertäter" momentan ganz wunderbar auf meiner neuen Defiant.